杉並区から通えるフリースクール10選｜東京都の助成金と費用を公式情報で比較【2026年版】

杉並区で最初に知っておきたい「お金」の話

杉並区立小中学校の不登校児童生徒数は、令和5年（2023年）で1,105人でした。10年前の平成26年（2014年）は235人ですから、約4.7倍です。区の『子どもの居場所づくり基本方針（素案）』に載っている数字です。

出典：杉並区「子どもの居場所づくり基本方針（素案）」令和6年9月

東京都の助成は月額最大2万円。ただし「利用料のみ」です

ここが杉並区でフリースクールを探すときに、いちばん効いてくる情報です。東京都の「東京都フリースクール等利用者等支援事業（助成金）」は、都内在住の不登校の小・中学生の保護者に対して、フリースクール等の利用料を小・中学生1人につき月額最大2万円まで助成する制度です。四半期ごとに支給されます。

「入会金は対象外」という一点を落とすと、見通しが大きく狂います。たとえばこの記事で扱うのびーくフリースクールは入会金110,000円（税込）ですが、助成の対象になるのは月額の利用料だけです。いっぽうで、月額がちょうど2万円の施設（そらいろのいえ、明光のライトコースなど）なら、審査を通れば利用料の負担が実質ゼロに近づく計算になります。

まぎらわしい「もうひとつの事業」に注意してください

東京都には名前のよく似た事業が2つあります。

保護者が使えるのは上の「利用者等支援事業」です。ウェブサイトも別で、検索で下の事業のページにたどり着いて「講習を受けないといけないのか」と誤解してしまうことがあります。

もうひとつ、「調査研究に協力すると助成が受けられる」という情報は古いです。これは令和5年度の初期の枠組みで、令和6年度以降は助成金として制度化され、調査研究への協力は要件になっていません。

出典：東京都「東京都フリースクール等利用者等支援事業」／東京都生活文化局（2026年9月確認）

杉並区独自の助成は、確認できませんでした

品川区・北区・港区・荒川区などでは区独自のフリースクール利用料助成が実施されていますが、杉並区独自の助成制度は、区の公式サイトにも東京都のポータル「TOKYO多様な学びの場・居場所ナビ」の杉並区ページにも記載を確認できませんでした（2026年9月時点）。使えるのは都の制度、という前提で計算してください。

【一覧表】杉並区から通えるフリースクール10選

費用と対象を先に一覧で比べられるようにしました。「公式に記載なし」は、公式サイトに書かれていなかったという意味です。埋めずにそのまま残しています。

まず確認したい公的な受け皿と、杉並区内の2か所

最初に、区が設置している公的な受け皿を確認します。そのあと杉並区内の民間施設2か所。どちらも駅から徒歩数分で、区内で通える貴重な選択肢です。

1 さざんかステップアップ教室／高井戸チャレンジクラス

杉並区が設置している公的な受け皿です。さざんかステップアップ教室は4教室あり、和田（和田1丁目41番10号3階／中学生）、天沼（本天沼3丁目10番20号／中学生）、宮前（宮前5丁目5番27号／小学5〜6年生・中学生）、荻窪（天沼3丁目15番20号3階／小学生）。区の説明は「不登校状態にある区内の児童・生徒を対象に、心のエネルギーを高めていく活動や小集団による学習、課外活動を行っています」です。

令和7年4月現在の在籍者数も区の資料に載っています。宮前（小3名・中24名）、天沼23名、和田15名、荻窪29名。実際に何人通っているかが分かる資料は多くないので、規模感をつかむのに役立ちます。

もうひとつ、高井戸チャレンジクラス（TCC）があります。高井戸中学校内の分教室で、対象は「杉並区在住で、年間30日以上欠席もしくは欠席が年間30日未満でも、継続的な不登校又は不登校傾向の中学生」。開所は月〜金の9:30〜15:00です。申し込みは「在籍校校長に入級希望を伝える→見学→三者面談→体験入級申込書を高井戸中学校に提出→体験入級実施→入級申請書を在籍校校長に提出→入級審査会で審査」という流れで、在籍校の校長が起点になっています。

なお、利用料と出席扱いの取り扱いは、区の公式サイト・案内PDFのいずれにも記載がありませんでした。開所時間（月〜金 8:30〜17:00）は東京都のポータルに載っています。区の資料より都のポータルのほうが情報が整理されている、という逆転が起きているので、あわせて見るとよいです。

Googleマップで場所を見る（さざんか＝和田）

出典：杉並区「不登校支援事業」／TOKYO多様な学びの場・居場所ナビ（2026年9月確認）

2 Mスクール

荻窪駅北口から徒歩3分。杉並区内にあり、通学のしやすさではこの10か所のなかで随一です。

探究活動・体験学習・ディスカッションを中心に、個別学習、コミュニケーション、アート・英語教育を組み合わせた選択可能な時間割制をとっています。月1回の「親カフェ」があり、保護者同士がつながれる場が用意されているのも特徴です。

出席扱いについては「出席扱いとなる場合もありますので、まずは学校の先生にご相談ください」と書かれています。断定せず、学校に相談するよう促している点は正確な説明です。

⚠️ 現在、小学生の新規受け入れを停止中と公式サイトに記載があります。対象は「小学5年生〜中学生を対象としたフリースクール」ですが、問い合わせる前に最新の受け入れ状況を確認してください。費用は公式サイトに記載がありませんでした。

Googleマップで場所を見る（東京都杉並区天沼2丁目4-1 井上ビル3号館202号室）

出典：Mスクール 公式サイト（2026年9月確認）

3 明光フリースクール 南阿佐ヶ谷新高円寺校

丸ノ内線の南阿佐ヶ谷駅・新高円寺駅からそれぞれ徒歩7分。杉並区内で、料金をコース別に完全公開している施設です。

入会金22,000円（税込）、月額はライトコース（週1回）20,000円、ステップコース（週3回）55,000円、バランスコース（週5回）71,500円（いずれも税込）。ライトコースの月額がちょうど2万円なので、東京都の助成の上限と一致します。審査を通れば、利用料の負担がほぼ相殺される計算になります（入会金22,000円は助成の対象外です）。

明光義塾の個別指導のノウハウを転用した個別支援で、学び直しに加えてプログラミング・eスポーツにも対応しています。公式サイトには東京都の助成金の対象実績（月額2万円）があると明記されています。出席扱いについては記載がありませんでした。

Googleマップで場所を見る（東京都杉並区阿佐谷南1-1-4 デュオメゾン高円寺南1F）

出典：明光フリースクール 南阿佐ヶ谷新高円寺校（2026年9月確認）

中野区・練馬区の4か所

杉並区の東と北。無料の入口を持つ巡回型、出席証明書を発行する高額帯、都の助成の上限とぴったり同じ月額の場所、そして地域コミュニティ型。性格がまったく違う4か所です。

4 ito-いと-（つながるいと）

固定の教室を持たず、中野区内の区民活動センター等を巡回する形で運営されています。野方区民活動センター（野方五丁目3番1号／野方駅 徒歩2分）、新井区民活動センター（新井三丁目11番4号）、桃園区民活動センター（中央4丁目57-1）などが会場です。

いちばんの特徴は無料の入口があることです。フリースペースは月1回無料、不登校親の会も無料。そのうえでフリースクール（週1〜2回、10:00〜16:00）が月額2万円で、減免制度があると明示されています。この記事で扱う10か所のなかで、減免をはっきり書いているのは数少ない施設です。

「まず無料の回に行ってみて、合いそうならフリースクールに」という段階を踏めます。月額2万円は東京都の助成の上限と一致するので、審査を通れば利用料の負担はかなり軽くなります。出席扱いについては記載がありませんでした。

Googleマップで場所を見る（固定拠点を持たず、中野区内の区民活動センター等を巡回）

出典：ito-いと- 公式サイト（2026年9月確認）

5 のびーくフリースクール

この10か所のなかで、出席扱いについていちばん踏み込んだ記述をしている施設です。「在籍校への『出席証明書』の提出で、出席扱いとなります。（在籍校の判断によります）」——出席証明書を発行していると明記しているところは多くありません。

料金体系も最も詳細です。入会金110,000円（税込）、年会費（グループコース26,400円／個別コース週1回13,200円）、月額はベーシック77,000円・週3回55,000円・週2回44,000円・中高生クラス55,000円、個別コースは1時間30,800円。体験は2回まで11,000円。すべて税込で公開されています。

ただし注意が必要です。東京都の助成の対象は「利用料」のみで、入会金110,000円は対象外です。月額77,000円のベーシックなら助成2万円を差し引いても月57,000円、初年度は入会金と年会費が上乗せになります。ここは必ず年間総額で計算してください。

子ども自身がプログラムを作る運営で、個別サポートプランを一人ずつ作成しています。開所は小中学生ベーシックが月〜金9:45-17:00、中高生クラスが火・金15:00-17:00です。

Googleマップで場所を見る（東京都練馬区東大泉4-13-3）

出典：のびーくフリースクール スクール情報（2026年9月確認）

6 子どもたちのためのフリースペース＜そらいろのいえ＞

月曜から金曜の10:00〜13:30という、午前中だけの開所です。朝から動くのがしんどい日でも、13時半までと決まっていると見通しが立てやすい、という子は少なくありません。

月額は2万円。東京都の助成の上限とぴったり同じ金額です。公式サイトにも「都内の小・中学生の方には、東京都フリースクール等利用者助成金が活用できる可能性があります」と書かれています。審査を通れば、利用料の負担が実質ゼロに近づく計算になります（入会金についての記載はありませんでした）。

昼食はお弁当持参。個別サポートを含む定額制です。出席扱いについては公式サイトに記載がありませんでした。

Googleマップで場所を見る（東京都練馬区大泉町6丁目15-16）

出典：そらいろのいえ 公式サイト（2026年9月確認）

7 特定非営利活動法人 石神井・小さなおうち

「不登校・子どもの居場所、地域交流の場所」として活動しているNPO法人です。この記事で扱う他の施設と性格が違い、学校の代わりというより地域のコミュニティに近い場所です。

運営しているのは、不登校の居場所のほかに「みんなの居場所」「ゆめとも文庫」「学校に馴染めない子どもの親相談会」「石神井プレーパーク」。プレーパークと子ども文庫と親の相談会が同じ団体のなかにあるので、子どもだけでなく保護者にも入口があります。

ただし対象・開所日時・費用のいずれも公式サイトに記載がありませんでした。「まず様子を見に行く」段階の選択肢として、親相談会やプレーパークから接点を持つのが現実的かもしれません。練馬区が公表している連携団体の一覧にも名前が載っています。

Googleマップで場所を見る（東京都練馬区石神井台2-26-26）

出典：NPO法人石神井・小さなおうち 公式サイト（2026年9月確認）

武蔵野市・三鷹市・世田谷区の3か所

杉並区の西と南。官民連携で土曜も開く場所、会費の内訳を公開している場所、そしてオンラインと組み合わせる形。

8 むさしのクレスコーレ

JR吉祥寺駅南口から徒歩6分。NPO法人文化学習協同ネットワークが、武蔵野市教育委員会との協力で運営しています。この10か所のなかで唯一の官民連携型です。

対象は「学校に行かない・行けない中学生」。開所は「祝日、年末年始を除く火〜土曜日9:00〜14:00（夏休み中も一部期間を除き開室）」。土曜も開いているのは珍しく、平日に人と会うのがしんどい時期の選択肢になります。

家庭訪問にも対応していて、スクールソーシャルワーカー（0422-60-1971）が相談・支援を担当しています。

⚠️ 武蔵野市在住の中学生向けの事業である可能性が高く、杉並区民が利用できるかは公式サイトから確認できませんでした。費用の記載もありません。問い合わせのときに、まず「区外から利用できますか」と聞いてください。

Googleマップで場所を見る（東京都武蔵野市御殿山1-6-8 ムサシヤビル1階）

出典：むさしのクレスコーレ 公式サイト（2026年9月確認）

9 フリースペース コスモ

認定特定非営利活動法人 文化学習協同ネットワークが運営しています。上のむさしのクレスコーレと同じ法人ですが、別の場所・別の性格の事業です。

費用の見せ方に特徴があります。月会費52,000円の内訳が基本会費20,000円＋活動参加費32,000円と公開されています。何にいくら払っているのかが分かるのは、比較するうえでありがたい情報です。体験入会は3回まで無料。

対象は小学1年生から中学3年生（高校生の相談も受付）。開所は月〜金の10:00〜17:00（木曜日は基本的に13:00〜）。小1から中3までが同じ空間で過ごす異年齢の場です。

運営方針が明文化されているのも特徴で、「いつ来てもいいし、いつ帰ってもいい。何をしてもいいし、何もしなくてもいい」と書かれています。練馬区が公表している連携団体の一覧にも名前が載っています。出席扱いについては記載がありませんでした。

Googleマップで場所を見る（東京都三鷹市下連雀1-14-3 3F）

出典：フリースペース コスモ 公式サイト（2026年9月確認）

10 NIJINアカデミー世田谷下高井戸8D校

杉並区に隣接する世田谷区下高井戸のリアル教室と、平日毎日開いているメタバース校舎を組み合わせて通う形です。開校は水曜・木曜・金曜の10時〜15時、定員6〜7名、対象は小学生・中学生です。

他の9か所と違うのは、教室に通うのが週1日で、残りの平日は家からメタバース校舎に通うという設計になっている点です。杉並区内に通える場所が見つからなくても、「近くに教室がない」という理由で選択肢が消えないことが、このかたちの意味です。

教室長の大橋潤子さん（通称・しめじゅん）は保育士・幼稚園教諭・コグトレ上級トレーナーの資格を持ち、放課後の習い事「8Dこども教室」を10年間運営してきた方です。発達特性のあるお子さんの母親でもあります。声優の経験を活かして、演劇的な手法や表現教育にも力を入れています。

なお公式サイトに「都内の小・中学生の方には東京都フリースクール等利用料助成金が活用できる可能性があります」と記載があります。杉並区在住であれば、都の助成の対象になりうるということです。

Googleマップで場所を見る（東京都世田谷区下高井戸）

出典：NIJINアカデミー世田谷下高井戸8D校（2026年9月確認）

杉並区の公的な支援と、2028年に増える選択肢

杉並区で使える公的なものを整理しておきます。区の情報公開が薄い領域があるので、都のポータルもあわせて見るのがコツです。

1. 校内別室と、さざんか／高井戸チャレンジクラス
区は校内別室について「自分のクラスに入りづらい児童・生徒が落ち着いた空間の中で自分に合ったペースで生活・学習できる居場所を設置しています」と説明しています。ただし設置校数・設置校名は公表されていません。『杉並区教育ビジョン2022推進計画』には「校内別室指導支援事業の検討」（令和6年度）→「実施」（令和7〜8年度）という工程が記載されています。まずは在籍校に、校内に別室があるかを聞いてみてください。

2. 令和10年4月、杉並区に学びの多様化学校ができます
これは、いま検索してもほとんど出てこない情報です。杉並区は公式サイトで次のように公表しています。

現時点では文部科学省の設置者一覧に杉並区の記載はありません（都内では八王子市立高尾山学園、東京シューレ葛飾中学校、世田谷区立世田谷中学校「ねいろ」、大田区立御園中学校「みらい学園」など13校）。いま小学校高学年のお子さんなら、中学の途中で選択肢が増える可能性があるということです。ただし開設予定は変更されうるので、2026年9月時点の区の発表としてご覧ください。

出典：杉並区「不登校支援事業」／文部科学省「学びの多様化学校の設置者一覧」

3. 出席扱いの基準は、杉並区は公表していません
区の不登校支援事業ページ、さざんかの案内PDF、高井戸チャレンジクラスのページのいずれにも、民間施設を利用したときの出席扱いの基準・様式・手続きの記載はありませんでした。判断するのは在籍校の校長です。まず担任か管理職に相談してください。

参考までに、隣の練馬区は連携している14団体を実名で公表しています。ただしそれも「情報共有や意見交換」を目的とした連携会議であって、出席扱いの認定基準ではありません。「連携団体だから出席扱いになる」とは読まないでください。

杉並区内に通える場所が見つからないときの選択肢

杉並区内のフリースクールは、この記事で見たとおり数が限られています。区外に目を向けると中野区・練馬区・武蔵野市・三鷹市に候補が広がりますが、毎日区をまたいで通うのは現実的でないことが多いはずです。「近所にちょうどいい場所がなかった」で検討が止まってしまうのが、いちばん起きやすいことだと思います。

NIJINアカデミーは、メタバース校舎（オンライン）を本体にして、リアル教室を週1日足すという構成をとっています。杉並区の隣、世田谷区下高井戸の世田谷下高井戸8D校は水・木・金に開校していて、京王線で通えます。教室が通いにくい場合でも、メタバース校舎だけで通うことができます。

そして杉並区在住であれば、東京都の助成（月額最大2万円・利用料が対象）の対象になりうる点も、費用を考えるうえで押さえておきたいところです。申請には審査があり、令和8年度の申請期間は令和8年5月27日〜令和9年2月12日です。

出典：NIJINアカデミー世田谷下高井戸8D校（2026年9月確認）

オンラインという選択肢｜NIJINアカデミーのメタバース通学

メタバース校舎は平日毎日開いています。月100コマ用意されている授業から、受けたいものを自分で選んで参加する形です。クラスは8〜10人の少人数で、異年齢で構成され、担任の先生がつきます。

最初は顔も声も出さなくてかまいません。チャットだけの参加から始める子がほとんどです。画面の向こうに人がいることに慣れてから、少しずつ関わり方を選んでいけます。全国から900名を超える子どもたちが通っているので、同じ学年・同じ興味の子が必ずどこかにいます。

費用はメタバース通学が月25,443円（税込・メタ利用料1,683円を含む）。年払いにするとメタバース授業料が月あたり19,800円になります。東京都の助成の対象になる場合、対象は利用料であり入会金は含まれない点にご注意ください。

NIJINアカデミーの雰囲気を見る

年中でいじめと体調不良を経験し、小1で自ら新しい学びの道を決めた子のお話です。

出席扱いを相談するときの進め方

フリースクールに通えば自動的に出席になる制度ではありません。文部科学省の通知は、校長が設置者である教育委員会と十分に連携をとって判断するものと定めています。判断するのは在籍校です。

1. 施設を決める前に、担任の先生に相談する「学校の外で学ぶことを考えています。出席扱いについて相談させてください」と伝えます。施設が決まっていない段階でかまいません。事後報告より、検討中に話しておくほうが進みます。
2. 市町村の教育委員会 学校教育課に問い合わせる校長は教育委員会と連携して判断するため、市町村教委が実質的な窓口です。市役所の代表番号から「教育委員会 学校教育課」につないでもらえます。
3. 公的な教育支援センターを先に確認する通知は、まず教育委員会等が設置する公的機関を基本としています。無料または低額で、出席扱いにも対応していることが多いため、話が整理されます。
4. 民間・オンラインを検討するここで施設側に「出席扱いの実績はありますか」「学校へ渡す記録は出してもらえますか」「頻度はどのくらいですか」を必ず確認します。
5. 記録を学校に提出し、判断を待つ判断には時間がかかることがあります。学期の途中でも、早めに動くほうが安全です。

参考：文部科学省「不登校児童生徒への支援の在り方について（通知）」令和元年10月25日

よくある質問

まとめ

杉並区で学校以外の通い先を探すときに、この記事で押さえておきたいことは3つです。

1. 東京都の助成は「利用料」だけが対象です月額最大2万円、四半期ごとの支給、申請と審査が必要。入会金・施設維持費・教材費は対象外です。入会金110,000円の施設もあるので、月謝だけを見て決めず、初年度の総額で比べてください。名前の似た「支援事業」は事業者向けなので間違えないように。
2. 杉並区は出席扱いの基準を公表していません判断するのは在籍校の校長です。この記事の10か所のうち、出席扱いに公式に言及しているのは、のびーく（出席証明書を発行）とMスクール（場合あり）の2か所だけでした。「対応可能」と「実績がある」は違います。見学のときに必ず聞いてください。
3. 令和10年4月、杉並区に学びの多様化学校ができる予定です高南中学校の分教室型で、旧高円寺図書館に約50名規模。いま小学校高学年のお子さんなら、中学の途中で選択肢が増える可能性があります。

どこを選ぶにしても、決める前にひとつだけ先にやっておいてほしいことがあります。担任の先生に「学校の外で学ぶことを考えています」と伝えておくことです。施設が決まっていない段階でかまいません。出席扱いを判断するのは在籍校なので、事後報告より、検討している段階で話しておいたほうが話が進みます。