函館市のフリースクール6選｜利用料0円のサポートベース函館と月2.5万円前後の民間【2026年最新】

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授業と休み時間のようすを、実際に体験できます。日程はカレンダーからその場で選べます。

在籍900名超／出席認定希望者の97%（しくみを見る）／少人数8〜10人制

北海道函館市は、五稜郭・本町・湯の川・美原と生活圏が広がり、北斗市・七飯町と隣り合う道南の中心都市です。学校に行けない日が続いたとき、どこに相談し、どこに通えるのかを、公式情報だけで整理しました。

まず知っておきたいのは、函館市には利用料のかからない公的な居場所「サポートベース函館」があることです。場所は湯川町の南北海道教育センター3階、開所は平日10:00〜14:00。一方でフリースクール利用料の助成制度は、函館市・北海道とも公式サイト上に確認できませんでした。民間施設の費用は各家庭の負担になります。

この記事は、函館市・北海道教育委員会・文部科学省および各施設の公式サイトで確認できた内容だけで作りました。確認できなかった項目は「記載なし（要問合せ）」と書いています。

結論：函館市のフリースクール選びの要点

選択肢は6か所——函館市の学びの場を、公的な支援・民間フリースクール・オンラインに分けて、費用・開所日時・出席扱いの対応とあわせて一覧表にまとめました
この記事のポイント——利用料0円のサポートベース函館と月2.5万円前後の民間（2026年9月時点・各公式情報で確認）
出席扱いは在籍校の校長が判断——通えば自動的に出席になるわけではありません。施設を決める前に担任の先生と教育委員会へ相談するのが近道です（文部科学省通知令和元年10月25日）
外出が難しい日はオンラインも——NIJINアカデミーのメタバース校舎は平日毎日開校、月100コマ、顔も声も出さずに参加でき、出席扱いを希望した生徒の97%が在籍校で出席として認められています

この記事でわかること

函館市の公的な居場所「サポートベース函館」の場所・対象・時間・費用・利用までの流れ
函館市・北海道のフリースクール利用料助成について、公式サイトで確認できたこと
北海道教育委員会の施設一覧に載る函館市内の民間施設と、その公式サイトの記載
函館市内3か所・七飯町1か所・オンライン2か所の費用・対象・開所日時・出席扱いの記載
在籍校で出席扱いを相談する順番と、見学で聞いておきたいこと

函館市でフリースクールを探すときに、先に押さえておきたい3つのこと

1. 函館市の公的な居場所は「サポートベース函館」です

函館市教育委員会が設けている居場所は「サポートベース函館」です。市のページでは「新たな居場所サポートベース函館 -社会的自立に向けた第一歩-」と紹介され、場所は南北海道教育センター3階（函館市湯川町3丁目38番38号）。利用料金はかかりませんが、通級のための交通費や行事の諸費用は保護者負担です。

2. フリースクール利用料の助成は、市・道とも確認できませんでした

2026年9月時点で、函館市・北海道のいずれの公式サイトにも、保護者向けのフリースクール利用料の助成制度は確認できませんでした。北海道教育委員会は「フリースクールなど民間の相談・指導施設一覧」（令和8年9月16日現在 67施設）を公開しており、函館市からは3施設が掲載されています。

3. 「出席扱い」は施設ではなく、在籍校が判断します

文部科学省の通知（令和元年10月25日「不登校児童生徒への支援の在り方について」）は、民間施設等での学習について、保護者と学校の間に十分な連携・協力関係があること、学習の計画や内容が在籍校の教育課程に照らし適切と判断されることなどを要件に、校長が教育委員会と連携して出席扱いを判断するとしています。自宅でのICT等を活用した学習についても、同様に要件が示されています。

この記事の「出席扱い」欄は、施設側が公式サイトに何と書いているかを写したものです。最終判断は在籍校と函館市教育委員会にあります。

立ち止まってしまう場所

函館市で学校に行けない日が続いたとき3つの不安

「どこから手をつければいいか分からない」の中身は、だいたいこの3つに整理できます。

進路への不安

勉強の遅れや、出席日数が高校受験にどう響くかが気になります。判断するのは在籍校なので、施設を決める前に担任の先生に「学校の外で学ぶことを考えています」と伝えておくと、話が進みやすくなります。

費用の壁

サポートベース函館は利用料0円。民間は、公式サイトに金額の記載がある施設で月25,000円前後からで、入会金が別にかかります。函館市・北海道の利用料助成は確認できなかったため、「初年度に支払う総額」で比べるのが確実です。

居場所が見つからない

函館市内の民間施設は、北海道教育委員会の一覧に載るのが3か所。開所日が週4日だったり、夕方から夜の時間帯だったりと、施設ごとに形が違います。平日5日をどう埋めるかを、組み合わせで考える場面が出てきます。

まずサポートベース函館（0138-57-8251）に相談し、そのうえで民間やオンラインを比べる順番が、いちばん迷いにくい進め方です。

【一覧表】函館市とその周辺から通えるフリースクール6か所

函館市内の3か所、七飯町から通える1か所、函館市から自宅で参加できるオンライン2か所です。費用・対象は各施設の公式サイトの記載をそのまま掲載しました（2026年9月確認）。

施設名	市町村	種別	対象	費用
01 函館圏フリースクールすまいる	函館市（富岡町）	民間（一般社団法人）	小学1年生〜高校生年代	記載なし（要問合せ）
02 リエゾンスクール	函館市（本町）	民間（ファーストナレッジ株式会社）	小学生・中学生（高校生以上は要相談）	入会金20,000円／月額25,000円（昼の部）
03 トライ式中等部函館キャンパス	函館市（本町）	民間（トライ式高等学院）	中学生	記載なし（要問合せ）
04 フリースクールプレスタ	七飯町（鳴川）	民間（一般社団法人 KIDS ARE ALRIGHT）	小・中・高校生	利用回数で異なる（金額は要問合せ）／冷暖房費月1,000円・入会費なし
05 e-門（イーモン）	オンライン（札幌市）	民間（オンライン）	小学4〜6年生・中学生	入会金30,000円／小学生月25,000円・中学生月30,000円（週1日）
06 NIJINアカデミーメタバース校舎	オンライン	民間（オンライン）	小学1年生〜中学3年生	教育費月額23,760円＋施設利用料1,683円

函館市内のフリースクール3選

北海道教育委員会の「フリースクールなど民間の相談・指導施設一覧」に函館市から掲載されている施設と、函館市の保護者向け配布資料に名前のある施設のうち、公式サイトで内容を確認できたものです。

01 函館圏フリースクールすまいる

五稜郭エリアにある、一般社団法人が運営するフリースクールです。北海道教育委員会の施設一覧にも掲載されています。活動はフリースペース（居場所）、すまいるプラス（1対1支援）、不登校等相談、見学・体験、訪問等の4本立てです。

フリースペースは火〜金曜日の10:00〜15:00、自主学習・工作・運動など自主的な活動をサポートする形です。対象は小学1年生〜高校生年代で、常勤スタッフは2名。公式サイトでは在籍校との連絡をとり、出席や活動内容等について情報を共有していく方針を示しています。利用料の金額は公式サイト上で確認できませんでした。

所在地: 北海道函館市富岡町1丁目2-7
アクセス: JR五稜郭駅・市電五稜郭公園前より徒歩15分弱、函館バス「田家入口」から約5分
対象: 小学1年生〜高校生年代
開所日時: フリースペース：火〜金曜日 10:00〜15:00
費用: 記載なし（要問合せ）
出席扱い: 在籍校と連絡をとり、出席や活動内容等について情報を共有する方針（公式サイトの記載）
連絡先: 070-4156-3195／hakodate.smile@gmail.com

Googleマップで場所を見る（北海道函館市富岡町1丁目2-7）

出典：函館圏フリースクールすまいる公式サイト（2026年9月確認）

02 リエゾンスクール

函館を拠点に教育支援を行うファーストナレッジ株式会社が運営するスクールです。函館市の保護者向け配布資料にも「ファーストナレッジ」として連絡先が載っています。個性・特性に合った個別最適な学びのプログラムと環境を提案し、進学や就職などの相談相手になることを掲げています。

開所は月・火・木・金の週4日で、14:00〜16:00／16:00〜18:00の時間帯。費用は入会金20,000円、月額25,000円（昼の部）と公式サイトに明記されています。出席扱いについての記載は確認できませんでした。

所在地: 北海道函館市本町29-10
対象: 小学生・中学生（高校生以上は要相談）
開所日時: 月・火・木・金曜日 14:00〜16:00／16:00〜18:00
費用: 入会金20,000円／月額25,000円（昼の部）
出席扱い: 記載なし（要問合せ）
連絡先: 0138-76-4174／070-2343-5609／liaison@first-knowledge.com
運営: ファーストナレッジ株式会社

Googleマップで場所を見る（北海道函館市本町29-10）

出典：リエゾンスクール公式サイト（2026年9月確認）

03 トライ式中等部函館キャンパス

通信制高校サポート校のトライ式高等学院が運営する中学生向けのコースです。北海道教育委員会の施設一覧には「トライ式高等学院（中等部）函館キャンパス」として、本町のカーニープレイス函館1階が掲載されています。

トライ式中等部の公式ページでは、対面・オンラインで選ぶことができ、中学校長の判断により、中学校の出席日数として認めてもらうこともできますと案内されています。費用は「詳しくはお問い合わせください」とされ、金額の記載は確認できませんでした。函館キャンパスの開所日時も公式サイト上で確認できなかったため、電話でご確認ください。

所在地: 北海道函館市本町3-12 カーニープレイス函館1F
対象: 中学生
開所日時: 記載なし（要問合せ）
費用: 記載なし（要問合せ）
出席扱い: 中学校長の判断により、中学校の出席日数として認めてもらうこともできる（公式サイトの記載）
連絡先: 0138-68-1400
通学スタイル: 対面・オンラインから選択

Googleマップで場所を見る（北海道函館市本町3-12 カーニープレイス函館1F）

出典：トライ式中等部公式サイト／北海道教育委員会フリースクールなど民間の相談・指導施設一覧（2026年9月確認）

七飯町から通える施設と、函館市から参加できるオンラインの選択肢

函館市内の施設は開所日や時間帯が限られるため、近隣の七飯町の施設と、自宅から参加できるオンラインのフリースクールも候補に入れました。

04 フリースクールプレスタ

2023年4月に七飯町にオープンした子ども支援団体「KIDS ARE ALRIGHT」が運営する居場所です。学習塾・通信制高校（鹿島学園高等学校と提携）・駄菓子屋とあわせて運営されています。

特徴は夜間のフリースペースであること。原則毎週火曜・木曜・土曜の17:00〜20:00に開いていて、コミュニケーションと遊び、学習もできる学びの場とされています。利用料は月4回・8回・9回以上のコースとスポット利用があり、冷暖房費として月1,000円、入会費はかかりません。各コースの金額と出席扱いの記載は確認できませんでした。

所在地: 北海道亀田郡七飯町鳴川1丁目5-3
対象: 小・中・高校生
開所日時: 原則毎週火曜・木曜・土曜 17:00〜20:00
費用: 月4回・8回・9回以上のコース／スポット利用（金額は要問合せ）／冷暖房費月1,000円／入会費なし
出席扱い: 記載なし（要問合せ）
連絡先: info.puresuta@gmail.com／公式LINE
運営: 一般社団法人 KIDS ARE ALRIGHT

Googleマップで場所を見る（北海道亀田郡七飯町鳴川1丁目5-3）

出典：フリースクールプレスタ公式サイト（2026年9月確認）

05 e-門（イーモン）

札幌を拠点とする、出席扱い制度への対応をうたうオンラインフリースクールです。道内の事業者なので、函館市から自宅で参加する候補になります。

授業は毎週月〜金の10:10〜15:50。費用は入会金30,000円、基本月謝が小学生25,000円・中学生30,000円（週1日の金額で、1日増ごとに+2,000円）と公式サイトに明記されています。出席扱いについては在学の学校長の判断で、学校への出席と同等の扱いや成績の評価を受けることができますとされています。無料の1日体験入会があります。

所在地: 記載なし（札幌市を拠点とする旨の記載のみ）
対象: 小学4〜6年生・中学生（その他学年は相談）
開所日時: 毎週月〜金曜日 10:10〜15:50
費用: 入会金30,000円／基本月謝小学生25,000円・中学生30,000円（週1日。1日増ごとに+2,000円）
出席扱い: 在学の学校長の判断で、出席と同等の扱いや成績の評価を受けることができる（公式サイトの記載）
連絡先: 011-600-0406／LINE・メールで相談可

出典：e-門公式サイト（2026年9月確認）

函館市の公的な支援｜サポートベース函館と相談窓口

サポートベース函館（南北海道教育センター3階）

対象は函館市内に在住し、さまざまな背景や要因、状態により登校できない状況にある児童生徒。開所は平日10:00〜14:00で、利用料金はかかりません（通級のための交通費や行事の諸費用は保護者負担）。南北海道教育センターへは市電「湯の川」下車徒歩8分、休館日は土日・祝日、年末年始です。

利用までの流れ：①保護者から申し出 → ②教育相談 → ③見学 → ④体験 → ⑤通所申込（申込書を提出） → ⑥通所開始。問い合わせは南北海道教育センター 0138-57-8251。出席扱いの取り扱いは、市のページに記載を確認できませんでした。申し出の際に、在籍校での扱いもあわせてご確認ください。

南北海道教育センターの教育相談

通所の前に、まず相談だけしたい段階の窓口です。電話相談は8:45〜17:30、面接相談は13:00〜17:30（いずれも土日祝日・年末年始を除く）、電話は0138-57-8251。このほか市の保護者向け配布資料には、函館市こころの相談員（月〜金 8:45〜17:30）や、函館市社会福祉協議会の不登校相談（毎月第2水曜 10:00〜12:00）も載っています。

学校の中の受け皿と、学びの多様化学校

函館市は不登校等への対応として、「チーム学校」として特定の教員が抱え込まずに対応することや、スクールカウンセラー・スクールソーシャルワーカー・南北海道教育センター・フリースクール等との連携を掲げています。保護者向け資料には保健室や相談室等の別室登校も選択肢として挙げられています。学びの多様化学校（いわゆる不登校特例校）の設置は、2026年9月時点で函館市公式サイト上に確認できませんでした。

助成制度について

函館市・北海道とも、保護者向けのフリースクール利用料助成は公式サイト上で確認できませんでした（2026年9月時点）。北海道教育委員会は民間施設の一覧を公開していますが、「各施設の活動内容等を保証するものではございません」と注記しています。見学で内容を確かめてから決めるのが前提です。

出典：函館市サポートベース函館／南北海道教育センター施設概要／教育相談・就学相談｜南北海道教育センター／函館市不登校等への包括的な対応について／北海道教育委員会フリースクールなど民間の相談・指導施設一覧（いずれも2026年9月確認）

3つの選択肢を正直に比較

サポートベース函館・民間フリースクール・NIJIN（オンライン）を6観点で

	サポートベース函館（市）	民間フリースクール	NIJIN（オンライン）
利用料がかからない	○	×	×
平日5日、参加できる場がある	○	△	○
対面で人と会い、体を動かす活動がある	○	○	×
雪の日や体調が読めない日でも、家から参加できる	×	△	○
顔も声も出さずに参加を始められる	△	△	○
出席扱いの実績が数字で示されている	△	△	○

○＝対応　△＝一部　×＝非対応　／　※一般的な傾向。費用・制度は2026年9月時点。NIJINは教育費月額23,760円＋施設利用料1,683円がかかります。

NIJINアカデミーという選択肢｜函館市からはメタバース校舎での参加が中心になります

NIJINアカデミーは、メタバース校舎を軸にしたオルタナティブスクールです。北海道内のリアル教室は札幌市内にあり（例：NIJINアカデミー札幌南校／札幌市南区・毎週月曜日 10:00〜15:00）、函館市から日常的に通う距離ではありません。函館市のご家庭には、自宅から参加するメタバース校舎が中心になります。

函館市内の施設は週4日の開所、夕方から夜の時間帯など、形がさまざまです。NIJINアカデミーのメタバース校舎は平日毎日開いているため、サポートベース函館や市内の施設に行けない日の受け皿として組み合わせることもできます。

形態: メタバース校舎（オンライン）
函館市から最も近いリアル教室: 札幌市内の教室（例：札幌南校札幌市南区澄川4条11丁目4-16／毎週月曜日 10:00〜15:00）
対象: 小学1年生〜中学3年生
開校: 平日毎日／月100コマ／少人数8〜10人
費用: 教育費月額23,760円（年払いの場合月あたり19,800円）＋施設利用料1,683円
出席扱い: 希望した生徒の97%が在籍校で出席として認められています（最終判断は在籍校）
在籍: 全国から900名を超える子どもたち

出典：NIJINアカデミー全国の教室一覧公式サイト（2026年9月確認）

オルタナティブスクールという選択肢

学校に合わないからこそ、輝く個性がある。

NIJINアカデミーは、日本初、公教育を持ち運び可能にした
オルタナティブスクール（小中高一貫校）です。

累計入学 900名超
出席認定率 97%（希望者）
全国52か所のリアル教室

LINEで無料相談する　→無料体験説明会の日程を見る

※出席扱いの最終判断は在籍校です。数字はNIJINアカデミー公式サイトの掲載値。

友だち追加は無料・相談だけでもOKです｜デジタルパンフレットを見る

オンラインという選択肢｜NIJINアカデミーのメタバース通学

函館市でフリースクールを探すと、2つの壁に当たります。

ひとつは開所日と時間帯です。サポートベース函館は平日10:00〜14:00、すまいるのフリースペースは火〜金、リエゾンスクールは月・火・木・金の午後、プレスタは火・木・土の夜。「平日5日をどう埋めるか」を考えると、組み合わせが必要になります。

もうひとつは移動と冬の天候です。湯川町・五稜郭・本町は市電やバスでつながっていますが、朝、家を出られるかが日によって変わる段階では、乗り継ぎや雪の日の移動が大きな負担になります。

NIJINアカデミーのメタバース校舎は、この隙間に入る選択肢です。平日は毎日開いていて、移動がありません。顔も声も出さずチャットだけで参加でき、少人数8〜10人のクラスに担任の先生がつきます。まずメタバース校舎で様子を見て、家を出られる日が増えてきたらサポートベース函館や市内の施設を見学する。週の埋め方の候補に入れてみてください。

メタバース校舎の特徴

平日毎日開校。月100コマの授業から、受けたいものを選んで参加できます
少人数8〜10人のクラス。異年齢で構成され、担任の先生がつきます
顔も声も出さずに参加できます。チャットだけでの参加からで大丈夫です
出席扱いを希望した生徒の97%が、在籍校で出席として認められています（最終判断は在籍校）
教育費月額23,760円（年払いの場合月あたり19,800円）＋施設利用料1,683円

NIJINアカデミーの雰囲気を見る

感覚の過敏さが理由で学校がつらくなったお子さんと、そのお母さんが「環境を変える」という答えにたどり着くまでの話です。越谷校に通うご家庭のインタビューです。

出席扱いを相談するときの進め方

フリースクールに通えば自動的に出席になる制度ではありません。文部科学省の通知は、校長が設置者である教育委員会と十分に連携をとって判断するものと定めています。判断するのは在籍校です。

施設を決める前に、担任の先生に相談する「学校の外で学ぶことを考えています。出席扱いについて相談させてください」と伝えます。施設が決まっていない段階でかまいません。事後報告より、検討中に話しておくほうが進みます。
区の教育委員会学務課・指導室に問い合わせる校長は教育委員会と連携して判断するため、区教委が実質的な窓口です。区役所の代表番号からつないでもらえます。
公的な教育支援センターを先に確認する通知は、まず教育委員会等が設置する公的機関を基本としています。無料または低額で、出席扱いにも対応していることが多いため、話が整理されます。
民間・オンラインを検討するここで施設側に「出席扱いの実績はありますか」「学校へ渡す記録は出してもらえますか」「頻度はどのくらいですか」を必ず確認します。
記録を学校に提出し、判断を待つ判断には時間がかかることがあります。学期の途中でも、早めに動くほうが安全です。

参考：文部科学省「不登校児童生徒への支援の在り方について（通知）」令和元年10月25日

見学のときに聞いておきたい6つのこと

1日の流れは決まっていますか、自由ですか——構造化された時間割が合う子と、自由なほうが合う子で真逆になります
今、何人くらい通っていますか。学年の内訳は——同年代がいるかどうかで、通い続けられるかが変わります
出席扱いの実績は何件くらいありますか——「対応可能」と「実績あり」は違います
学校に渡す記録は、どんな粒度で、どのくらいの頻度ですか——ここが曖昧だと学校が判断できません
途中で行けなくなったとき、費用はどうなりますか——日額制か月額制かで負担がまったく違います
送迎はありますか。ない場合、最寄りの公共交通は——通い続けられるかを決める、いちばん大きな要因です

よくある質問

函館市の小中学校に通っています。まずどこに相談すればいいですか？

在籍校の担任の先生と、南北海道教育センターの教育相談（0138-57-8251／電話相談 8:45〜17:30、土日祝日・年末年始を除く）です。サポートベース函館の利用も、保護者からの申し出と教育相談から始まります。

函館市の適応指導教室（教育支援センター）の名前と場所を教えてください。

函館市のページでは「サポートベース函館」として案内されています。場所は南北海道教育センター3階（函館市湯川町3丁目38番38号）、開所は平日10:00〜14:00です。対象は函館市内に在住し、登校できない状況にある児童生徒です。

サポートベース函館に費用はかかりますか？

利用料金はかかりません。ただし通級のための交通費や、行事にかかる諸費用などは保護者負担と案内されています。

函館市や北海道に、フリースクール利用料の助成はありますか？

2026年9月時点で、函館市・北海道のいずれの公式サイトにも、保護者向けのフリースクール利用料助成は確認できませんでした。制度は年度ごとに変わることがあるため、函館市教育委員会教育指導課（0138-21-3557）への確認をおすすめします。

函館市内の民間フリースクールは、費用がどれくらいかかりますか？

公式サイトに金額の記載があるのは、リエゾンスクール（入会金20,000円・月額25,000円／昼の部）です。函館圏フリースクールすまいるとトライ式中等部函館キャンパスは、金額の記載を確認できなかったため、直接お問い合わせください。

フリースクールに通えば、在籍校で出席扱いになりますか？

自動的にはなりません。文部科学省の通知では、保護者と学校の連携・協力関係や、学習の計画・内容が教育課程に照らして適切かどうかなどをもとに、校長が教育委員会と連携して判断します。検討している段階で担任の先生に伝えておくほうが進みます。

まとめ

函館市とその周辺から通える6か所と、函館市の公的な支援を見てきました。選び方の軸は3つです。

函館市での選び方

まず無料で相談・利用したいなら——南北海道教育センターの教育相談（0138-57-8251）と、サポートベース函館（平日10:00〜14:00・利用料0円）
対面で通える場を探すなら——函館圏フリースクールすまいる（火〜金 10:00〜15:00）、リエゾンスクール（週4日・月額25,000円）、トライ式中等部函館キャンパス、七飯町のフリースクールプレスタ（火・木・土の夜）
家から参加できる場を探すなら——e-門（月〜金）、NIJINアカデミーのメタバース校舎（平日毎日・月100コマ）

函館市の強みは、利用料のかからないサポートベース函館が平日毎日開いていること、そして北海道教育委員会が民間施設の一覧を公開していることです。一方で、フリースクール利用料の助成は市・道とも確認できませんでした。民間施設を検討するときは、入会金を含めた初年度の総額と、在籍校での出席扱いの見通しを、見学の段階で確かめておくと安心です。