港区のフリースクール10選｜一覧と費用・助成金について解説【2026年】

港区でフリースクールを探すときに、先に押さえておきたい3つのこと

1. 港区は、都の助成に区の助成を上乗せできる区です

東京都の「フリースクール等利用者支援事業」は、フリースクール等に通所する不登校の小・中学生の保護者に月額上限2万円を助成する制度です。

港区はこれに加えて、区独自の「港区フリースクール等利用料助成金」を令和7年度から実施しています。対象は都助成金の交付決定を受けている港区内在住の保護者で、区の上限も月額2万円。都と区を合わせると月額4万円までという設計です。

2. 都の助成対象一覧に載っている港区の施設は6か所です

東京都は助成金の交付決定の対象となった児童生徒の通所施設の一覧を公開しています。令和7年度版（全341施設）に港区所在として載っていたのは、いもいも デイクラス 三田校、コクーンアカデミア、東京モンテッソーリスクール、ビリーバーズ広尾、ワイズアカデミー 品川キャンパス、GIFTSchool の6か所です。

港区の助成は都の交付決定を受けていることが前提です。区の上乗せまで使うなら、検討中の施設が都の助成の対象になるかを早めに確認してください。

3. 「出席扱い」は施設ではなく、在籍校が判断します

フリースクールに通えば自動的に出席になる制度ではありません。文部科学省の通知（令和元年10月25日）は、校長が設置者である教育委員会と十分に連携をとって判断するものとしています。

この記事の「出席扱い」欄は、施設側が公式サイトに何と書いているかを写したものです。判断するのは在籍校の校長先生と港区教育委員会です。

【一覧表】港区とその周辺のフリースクール10か所

港区内7か所と、渋谷区・品川区から通える2か所、そしてオンラインの選択肢です。費用・対象・開所日時は各施設の公式サイトの記載をそのまま掲載しました（2026年9月確認）。

01〜04｜港区内の4施設｜高輪・六本木・南麻布

高輪・六本木・南麻布の4か所です。性格がまったく違うので、費用より先に「何をする場所か」で見てください。

01 ピットリーフリースクール

高輪3丁目、西町ビルの3B。公式サイトで「繊細なお子さん専門のフリースクール」と名乗り、合う・合わないを施設側が先に示している施設です。

開所は月曜から金曜の9時から15時まで。港区内7か所のなかで、平日5日すべて開いていることが公式サイトで確認できる数少ない施設です。

出席扱いについては、よくある質問に「在籍している学校の校長先生が、フリースクールに通うことで出席していると認めてくだされると、出席になります」とあり、施設からも学校側に相談に行くと書かれています。

Googleマップで場所を見る（東京都港区高輪3-7-8 西町ビル3B）

出典：ピットリーフリースクール 公式サイト（2026年9月確認）

02 コクーンアカデミア

六本木2丁目、六本木MYビルの1階。開室は10時から15時まで（土日祝を除く）で、対象は小学生・中学生・高校生と幅があります。

費用と出席扱いは公式サイト上で記載を確認できませんでした。都の令和7年度の助成対象施設一覧に港区所在として載っているので、区の上乗せ助成まで視野に入れる場合の候補になります。金額は電話（03-6416-9364）でご確認ください。

Googleマップで場所を見る（東京都港区六本木2-1-13 六本木MYビル1F）

出典：コクーンアカデミア 公式サイト／東京都 フリースクール等に関連する支援事業について（2026年9月確認）

03 ビリーバーズ広尾

南麻布5丁目、有栖川ビルの2階。名称に「小中高生のくつろぎスペース」とあるとおり、居場所としての性格が前面に出ている施設です。開所は月曜から金曜（祝日を除く）の10時から14時まで。

費用の組み立てが特徴的で、入会金も年会費も無料、そのうえで単発チケット6,900円、5回31,800円、10回52,000円、通い放題62,500円という形。「まず1回だけ行ってみる」ができる料金設計です。

出席扱いについては、公式ページに「ビリーバーズ広尾の利用者の中には、利用日が学校の出席扱いになっている子もいます」と書かれています。

Googleマップで場所を見る（東京都港区南麻布5-3-20 有栖川ビル2F）

出典：ビリーバーズ広尾 公式ページ（2026年9月確認）

04 ワイズアカデミー 品川キャンパス

名称に「品川」と入っていますが、所在地は港区高輪4丁目、ヒルズ高輪のA-302。品川駅から徒歩3分です。

対象は中学生に絞られ、公式サイトには「登校や勉強を強制することはありません」と自由登校の方針が示されています。

費用は年間330,000円と年額で示されています。月あたりに割り戻すと27,500円ほど。入会金の有無や分割可否、開所日時は確認できませんでした。

Googleマップで場所を見る（東京都港区高輪4-11-24 ヒルズ高輪 A-302）

出典：ワイズアカデミー 品川キャンパス 公式サイト（2026年9月確認）

05〜07｜港区内の3施設｜三田・白金台・西麻布

残りの3か所です。いずれも東京都の令和7年度の助成対象施設一覧に港区所在として掲載されています。

05 いもいも デイクラス 三田校

三田、慶應義塾大学の東門近く。三田駅から徒歩5分です。番地までの記載は公式サイトで確認できませんでした。

デイクラスは木曜日の10時30分から14時30分までの週1日。もともと思考力を育てる教室を運営する団体が、平日の日中に開いているクラスです。

費用は入会登録料が税込24,200円、月額授業料が税込35,475円、月額諸経費が税込3,630円。ほかに都度払い（1回税込14,960円）も選べます。出席扱いの記載は確認できませんでした。

出典：いもいも デイクラス 公式サイト（2026年9月確認）

06 東京モンテッソーリスクール

白金台2丁目26-7の3・4・5階。モンテッソーリ教育を小学部・中等部まで続けている学校で、対象は満6歳から。月曜から金曜の週5日制と公式サイトに書かれています。

費用の構成が他と大きく異なります。入学金110,000円、施設環境費が小学生660,000円・中学生330,000円、授業料は3期制で777,000円・798,000円・475,000円。年間で見ると、この記事のなかで最も大きい金額です。

都の助成対象施設一覧には掲載されていますが、都の助成の対象は「利用料」で、入学金・施設維持費・教材費は対象外です。どの費目が対象になるかは都と施設の両方に確認してください。

Googleマップで場所を見る（東京都港区白金台2-26-7 3・4・5F）

出典：東京モンテッソーリスクール 公式サイト（入学案内）（2026年9月確認）

07 GIFT School

西麻布3-8-18。3歳から15歳までが異年齢で混ざって過ごすマイクロスクールで、2020年4月に開校しました。

出席扱いについて、よくある質問に「公立の小・中学校に学籍を置きながら通うことで、出席扱いが認められます」と書かれ、在籍校へ「定期的に出席状況の報告及びレポートを提出」していることも明記されています。学校へ出す記録の運用まで書いている数少ない施設です。

費用は現在の公式サイトで金額を確認できませんでした。2026年9月時点の金額は要問合せです。

Googleマップで場所を見る（東京都港区西麻布3-8-18）

出典：GIFT School 公式サイト／NINJAWORKS株式会社 プレスリリース（2026年9月確認）

08〜10｜渋谷・品川から通える2施設と、オンラインという選択肢

地下鉄・JRで通える範囲の施設です。費用の幅も対象学年も港区内とは違うので、選択肢として持っておく価値があります。

08 フリースクールゆうがく

渋谷区代々木1-29-5の3階、代々木駅前。港区の赤坂・青山から地下鉄で出られます。

対象は小学5年生から中学3年生までで、高校生や既卒生も相談可能と書かれています。費用は入会金55,000円、月会費が週5コース48,000円・週2コース35,000円です。

出席扱いは「在籍校の校長の裁量で決まり、認められた場合ゆうがくに登校すれば在籍校の出席として扱われます」と明記されています。さらに「事情により在籍校へ報告されたくない場合には、そのように対応します」という記載もあり、学校との距離の取り方を選べる運用になっています。

Googleマップで場所を見る（東京都渋谷区代々木1-29-5 3F）

出典：フリースクールゆうがく 公式サイト（ご入会について）（2026年9月確認）

09 フリースクール かなめのもりのがっこう

品川区荏原3-5-4、かなめのもりのビル203。港区の高輪・白金台からは目黒経由で出られる範囲です。

対象は小学4年生以上18歳までと幅が広く、開所は平日の10時から14時50分までです。

費用は月額29,700円（税込）、入会金は「キャンペーン中」として0円と記載されています。平日5日開いていてこの金額は抑えめです。

Googleマップで場所を見る（東京都品川区荏原3-5-4 かなめのもりのビル203）

出典：フリースクール かなめのもりのがっこう 公式サイト（2026年9月確認）

10 NIJINアカデミー（メタバース校舎）

ここまでの9か所は、すべて「家を出て、電車に乗って、建物に入る」ことが前提です。朝、家を出られるかどうかが日によって変わる段階では、その前提自体が高い壁になります。

NIJINアカデミーは、平日毎日開いているメタバース校舎を中心にしたオルタナティブスクールです。全国から累計1000名を超える子どもたちが通い、月100コマの授業から選んで参加できます。費用は月額総額25,443円、初月のみ入学金33,000円。いちばん近いリアル教室は目黒区洗足です。

出典：NIJINアカデミー 学費・プラン（2026年9月確認）

港区の公的な支援｜つばさ教室・Minato School と、都＋区の助成

港区・東京都の公式サイトで確認できた内容を整理します。公的な通室先が2つあり、そのうえに区独自の助成が乗るという構成です。

適応指導教室「つばさ教室」（青山中学校内）

港区教育委員会が設置している教室で、場所は北青山1丁目1番9号、青山中学校内。対象は区公式サイトに「心理的な要因等により、長期間学校に登校することのできない港区に在住する児童・生徒」と書かれています。

開室は土日祝日・年末年始を除く日で、春休み・夏休み・冬休み期間中も開いています。登室は9時30分まで、最終退室は16時。活動は体育活動、外国語活動、栽培活動、手芸工作、調理実習、校外学習などです。

入室までの流れは、在籍校を通じて連絡 → 親子同伴での面談・見学 → 仮通室 → 申請書提出 → 教育委員会の入室審査委員会で審査 → 正式入室決定です。費用と出席の取り扱いは区公式サイトで記載を確認できませんでした（電話03-5422-1548）。

学びの多様化学校「Minato School」（虎ノ門）

令和7年度に新設された中学生対象の学びの多様化学校です。場所は虎ノ門3-6-9、対象は区内在住で30日以上登校できていない中学生、開校は月〜金の8時45分から16時まで（03-3578-3240）。

出典：港区 フリースクール等利用料助成金について／港区適応指導教室つばさ 公式サイト／港区 いじめ・不登校対策について／東京都 TOKYO多様な学びの場・居場所ナビ（港区）／東京都 フリースクール等に関連する支援事業について（2026年9月確認）

港区から通えるNIJINアカデミーのリアル教室｜目黒区洗足校

港区からいちばん近いNIJINアカデミーのリアル教室は、目黒区洗足1-28-2、ハートランドテラスの1階にある「目黒区洗足校」です。2025年5月3日に開校しました。

開校は週1日（火コース）、対象は小学1年生から中学3年生、定員5名という小さな規模です。港区の白金台・高輪あたりからは、目黒駅から東急目黒線で出られます。

ただし、週1日の開校なのでこの教室だけで週を埋めることはできません。だからNIJINアカデミーは、リアル教室と平日毎日開いているメタバース校舎を組み合わせる形をとっています。次の章で、そのメタバース校舎を説明します。

出典：株式会社NIJIN プレスリリース（目黒区洗足校 開校）（2026年9月確認）

オンラインという選択肢｜NIJINアカデミーのメタバース通学

港区でフリースクールを探すと、2つの壁にぶつかります。

ひとつは開所日数です。港区内7か所のうち、平日5日すべて開いていることが公式サイトで確認できるのはピットリーと東京モンテッソーリスクール。「毎日の居場所がほしい」という段階だと、候補がかなり絞られます。

もうひとつは費用です。金額が公開されているものだけでも、年間330,000円から200万円超まで幅があります。都と区の助成を合わせて月4万円まで使えるとはいえ、対象になるのは「利用料」だけです。

NIJINアカデミーのメタバース校舎は、この2つの隙間に入る選択肢です。平日は毎日開いていて、移動がありません。体調が読めない日でも、顔も声も出さずチャットだけで参加できます。

目黒区洗足校に火曜日だけ通い、残りの4日はメタバース校舎から参加する。あるいは、まずメタバース校舎で様子を見て、家を出られる日が増えてきたら港区内の施設を見学する。週の埋め方として候補に入れてみてください。

NIJINアカデミーの雰囲気を見る

NIJINアカデミーのスタッフが、子どもと保護者に向き合う日々をどんな思いで過ごしているかを話しています。メタバース校舎の雰囲気も映っています。

出席扱いを相談するときの進め方

フリースクールに通えば自動的に出席になる制度ではありません。文部科学省の通知は、校長が設置者である教育委員会と十分に連携をとって判断するものと定めています。判断するのは在籍校です。

1. 施設を決める前に、担任の先生に相談する「学校の外で学ぶことを考えています。出席扱いについて相談させてください」と伝えます。施設が決まっていない段階でかまいません。事後報告より、検討中に話しておくほうが進みます。
2. 区の教育委員会 学務課・指導室に問い合わせる校長は教育委員会と連携して判断するため、区教委が実質的な窓口です。区役所の代表番号からつないでもらえます。
3. 公的な教育支援センターを先に確認する通知は、まず教育委員会等が設置する公的機関を基本としています。無料または低額で、出席扱いにも対応していることが多いため、話が整理されます。
4. 民間・オンラインを検討するここで施設側に「出席扱いの実績はありますか」「学校へ渡す記録は出してもらえますか」「頻度はどのくらいですか」を必ず確認します。
5. 記録を学校に提出し、判断を待つ判断には時間がかかることがあります。学期の途中でも、早めに動くほうが安全です。

参考：文部科学省「不登校児童生徒への支援の在り方について（通知）」令和元年10月25日

よくある質問

まとめ

港区とその周辺の10か所を見てきました。選び方の軸は次の3つです。

港区は、公的な通室先が2つあり、そのうえに区独自の助成が乗る区です。制度の面では、都内でも動かせる手数が多いほうです。いっぽうで平日5日開いている民間施設は多くありません。「毎日の居場所」で見ると、埋まらない曜日が出てきます。

その隙間を埋める選択肢が、平日毎日開いているメタバース校舎です。10か所を見学して回る時間がまだない段階でも、家から授業を覗いてみることはできます。